বিদ্যালয়টি প্রথমে কালিতল নামক স্থানে সংক্ষিপ্ত আকারে প্রতিষ্ঠা হয়। পরে কোন এক সময় অপর্ণাচরণ নামক এক মহৎ ব্যক্তি ২ একর জায়গা জুড়ে অপর্ণাচরণ উচ্চ বিদ্যালয় প্রতিষ্ঠা করেন। তখন এলাকার গণ্যমান্য ব্যক্তিবর্গ জাফরনগর সরকারি প্রাথমিক বিদ্যালয়কে জাফরনগর অপর্ণাচরণ উচ্চ বিদ্যালয়ের উত্তর-পূর্ব পার্শ্বে ৪০ শতাংশ জায়গাজুড়ে প্রতিস্থাপন করেন। যাহা বর্তমান জাফরনগর সরকারি প্রাথমিক বিদ্যালয় নামে পরিচিত। বিদ্যালয়টির ৪০ শতাংশ জায়গা বি. এস জরিপে মালিকের ঘরে শিক্ষা বিভাগ চট্টগ্রাম এবং দখলের ঘরে জাফরনগর অপর্ণাচরণ উচ্চ বিদ্যালয় লেখা আছে। উল্লেখ্য যে, ১৯৭৩ খ্রিঃ থেকে অদ্যাবধি ৪০ শতাংশ এর খাজনা জাফরনগর সরকারি প্রাথমিক বিদ্যালয় পরিশোধ করেন। প্রতিষ্ঠাকাল থেকে উল্লেখযোগ্য যে সকল প্রধান শিক্ষক দায়িত্ব পালন করেন তাঁহারা হচ্ছেন (১) মহেন্ড কুমার দাশ (২) নাদেরুজ্জামান ভূঁইয়া- ১৯৬৮ থেকে ২৩/০৩/৯৪। (৩) আবুল হোসেন (ভারপ্রাপ্ত)- ২৪/০৩/৯৪ থৈকে ১৪/০৬/৯৫ (৪) রুবিনা পারভীন- ১৫/০৬/৯৫ থেকে ০৭/১২/৯৫ (৫) আবুল হোসেন- ০৯/১২/৯৫ থেকে ১৩/০৫/৯৬ (৬) এ. কে. এম. আবুল ভূঁইয়া- ১৪/০৫/৯৬ থেকে ২৮/০১/০৪ (৭) আবুল হোসেন- ২৯/০১/০৪ থেকে ০৪/০৮/১১ (৮) মঞ্জুরা বেগম (ভারপ্রাপ্ত)- ০৫/০৮/১১ থেকে ৩০/১২/১১ (৯) বর্তমান মোঃ নুরুল আমিন- ৩১/১২/১১ থেকে অদ্যাবধি।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস